结直肠癌综合分子特征揭示免疫细胞浸润基因预测

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结直肠癌（CRC）是一种在复杂的微环境中起病与进展的分子异质性疾病。肿瘤免疫细胞的浸润已被证实与CRC特异性和总生存率的提高相关。然而，CRC决定免疫浸润数量与类型的基因组特征在很大程度上尚未明确。


研究方法：


研究人员从两组大型前瞻性队列研究（护士健康研究和医务人员追踪研究）中选取了689例原发结直肠癌患者（pts）进行了全基因组测序和微卫星不稳定性（MSI）分析。用免疫组织化的方法标记了免疫浸润的特征（瘤周，瘤内腺体周围，Crohn's状，肿瘤浸润，和总淋巴细胞评分），同时对T细胞亚群（CD3+，CD8+，CD45RO+，FoxP3+）进行了组织微阵列成像分析。他们利用一种新的计算途径来计算肿瘤新抗原负荷（由体细胞突变产生的多肽，被免疫系统识别为异物），随后将肿瘤新抗原负荷与上述免疫变量和患者生存相关联。


研究结果：


相较于微卫星稳定肿瘤，微卫星高度不稳定的肿瘤明显会表达更多的新抗原（P＜2e-16）。在原发结直肠癌患者中，肿瘤新抗原负荷与总淋巴细胞评分（P=4.9e-9）和肿瘤浸润淋巴细胞（P=1.6e-15）显著相关。在T细胞亚群的分析中，肿瘤新抗原负荷仅与CD45RO+ T细胞亚群（P=0.0003）显著相关。肿瘤新抗原负荷越高预示着CRC特异性和总生存率更高（分别为P=0.014，P=0.048）。


结论：


本项大型前瞻性CRC分子特征的研究显示，肿瘤新抗原负荷预示着更多的肿瘤浸润淋巴细胞和记忆性T细胞浸润，可作为CRC患者生存的新型基因组预测指标。本研究将肿瘤基因组学与特定免疫反应元素相关联，对以后CRC的治疗决策有一定的影响。