癌症基因组图谱完成了卵巢癌的详细分析

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一项对卵巢癌中基因组变化的分析为所有类型癌症提供了迄今为止最全面、最完整的基因变化情况视图。研究人员通过“癌症基因组图谱”（TCGA）研究网络，对500位患者的卵巢浆液性腺癌进行了检测，其分析结果发表在2011年6月30日的Nature杂志上。

卵巢癌患者的5年存活率总体是31％，这意味着今年确诊的69％的患者在2016年就会不在世上了，凸显出进一步了解这种疾病的迫切需要。浆液性腺癌是卵巢癌最普遍的形式，约占所有卵巢癌死亡人数的85％。

TCGA研究人员在一种前所未有的316肿瘤中检测了基因组蛋白编码区，完成了全外显子组测序。研究人员还在这些肿瘤和另外173个样本中完成了其它基因鉴定。

此次研究的成果之一是证实了在所有卵巢癌中，超过96％都存在TP53单基因突变。TP53编码一种肿瘤抑制蛋白，这种蛋白可以防止癌症的形成。该基因的突变会破坏这种蛋白质的功能，进而导致卵巢细胞的生长失控。此外，研究人员还鉴定出了其它基因中的大量低频次突变。

BRCA1和BRCA2基因的突变会导致某些形式的乳腺癌，也会增加卵巢癌的风险。在这项研究中，大约21％的肿瘤带有这些基因的突变。对这些肿瘤的分析印证了所观察到的一点，即带有BRCA1和BRCA2基因突变的患者相对于没有这些基因突变的患者有着更高的存活几率。重要的是，研究人员鉴定出了BRCA1和BRCA2基因存在缺陷关乎生存的机制。如果BRCA1或者BRCA2基因发生突变，存活期将延长。但是，如果BRCA1活性是因甲基化而降低，存活期将不会被延长。

TCGA研究人员还揭示出基因的表达模式如何预测病人存活率，鉴定出与低存活率相关的108种基因和与高存活率相关的85种基因的表达模式。如果患者肿瘤中带有与低存活率相关的基因表达特征，其存活时间比不带有这种特征肿瘤的患者短23%。

研究人员表示，卵巢癌基因组变化的新发现显示出这种疾病的分子催化剂并不局限于单个基因的微小变化，发生在基因组中的大的结构性变化也相当重要。癌症研究人员可以利用这一综合信息，更好地了解卵巢癌的生物学机制，改善对这种可怕的疾病诊断和治疗。

为了寻找靶向治疗可能途径，研究人员对现有的药物进行了搜索，以期找到抑制卵巢癌中被扩增或过表达的基因的药物。研究人员最后鉴定出了68种可以被现有的治疗性化合物靶向的基因，这些化合物包括获FDA批准的以及实验性的。研究人员指出，一种作为PARP（聚ADP核糖聚合酶）抑制剂的药物，其可以对抗在一半以上的被研究的卵巢肿瘤中都存在的DNA修复基因。虽然研究人员已经知道这些药物对卵巢癌是有效的，这项研究进一步显示，50％的卵巢癌肿瘤对药物响应可能是利用肿瘤的遗传不稳定性而致使癌细胞死亡的。

这项研究的结果支持目前根据DNA转录模式的不同将卵巢癌分成四个亚型，也支持根据DNA甲基化模式的不同分成四个相关亚型。这些模式可能反映了与卵巢浆液性腺癌相关的功能改变，但与存活期的关系并不大。