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[专业资源] 二代测序技术应用于临床肿瘤精准诊治的共识

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1# 楼主
发表于 2017-3-23 13:00 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式

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NGS是一种高通量的大规模平行测序技术,可以同步获得肿瘤患者个体特定样本中数以十亿计的DNA碱基序列信息,是发现已知和未知疾病相关基因变异的高效手段。尽管在单基因遗传病、产前诊断等方面已经有广泛应用,但是当前 NGS 用于肿瘤基因检测仍缺乏统一规范和共识。

我国肿瘤患者数目庞大,基因诊断和检测需求巨大,而实际应用中,因为准入门槛低、缺乏业界公认的指导规范,可能存在检测质量低下、结果准确性差、解读不专业,甚至盲目追求基因检测结果等现象。为了推动实现NGS临床检测的规范化,CSCO理事长吴一龙教授、CSCO副理事长秦叔逵教授于2015年指导成立了CAGC,并启动精准肿瘤学研究项目(CAGC POI。作为项目的第一阶段计划,CSCOCAGC组织实验室癌症遗传学家、临床肿瘤学家、生物信息学专家、病理学家等专业成员修订本《共识》。

《共识》提出的主要目的是保证临床实践中得到的二代测序检测数据准确可靠,对临床决策有所帮助,最终可以使患者获益。精准诊断先行,才有治疗的精准方案及对患者疾病全程的精准管理。疾病防止过程中,精准诊断是三个精准的首要环节,是起到先进雷达搜索攻击目标靶点式的关键作用。

《共识》关注并阐述了NGS技术质量需求、临床肿瘤相关NGS检测内容、样本处理、测序流程、数据管理、信息学分析、结果报告解释和咨询、以及知情同意、NGS用于研究与诊断的区别、CAGC POI 项目 NGS 测试的监督等9方面内容,并在每部分内容中针对关键点提出声明,共有36项声明。

《共识》特别使用单独章节明确区分了诊断目的和研究目的NGS检测。《共识》定义,前者是为了回答患者肿瘤是否存在特定的基因变异状态,以协助临床及药物治疗决策,这种检验需要在得到认证的实验室开展;而后者是针对某种研究假设开展的检测,结果通常不具有明确的临床意义,因此需要在进一步诊断条件下确证才能纳入患者的医疗记录。且两者均需建立数据库。

《共识》同时配发《NGS检测报告格式化模板》用以指导检测结果的临床报告,目的是确保检测方以标准化、全面充分但又简明易懂的方式为临床医生提供信息,协助其用于患者的靶向治疗方案的决策。张绪超教授解释:“NGS 临床报告非常关键,对临床治疗决策起到引导作用,因此需要基于实验室癌症遗传学、分子生物学、生物信息学家以及病理 学多学科专家对于检验结果的共同清晰的认识和解读。

随后的共识发布会议,由四川大学华西医院的卢铀教授主持,广东省人民医院的张绪超教授、北京协和医院的梁智勇教授、上海南方基因组中心王升跃研究员等三位领域专家分别从“NGS共识总体介绍标本处理和分析报告“NGS技术流程和生物信息学分析等角度对共识进行简明介绍。

专家组成员也提出,由于肿瘤驱动基因研究以及基因检测技术进展非常迅速,在这一版《共识》的基础上,CAGC POI专家组将广泛收集相关意见和建议,并指导共识的下一步修订和更新。

转自CC**临床频道

2# 沙发
发表于 2017-4-2 20:58 | 只看该作者
受教了!谢谢分享!学习

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